عند مرور المياه عبر خلية المعالجة الكهربائية، تحدث عدة تفاعلات في وقت واحد.
في البداية، يتم دفع أيون معدني إلى داخل المياه. وعلى سطح الكاثود، يتحلل الماء إلى غاز الهيدروجين ومجموعات الهيدروكسيل.
في الوقت نفسه، تتدفق الإلكترونات بحرية مما يؤدي إلى زعزعة الشحنات السطحية على الجزيئات العالقة والزيوت المستحلبة.
ومع استمرار التفاعل، تتكون كتل كبيرة (flocs) تعمل على احتجاز المواد الصلبة العالقة، والمعادن الثقيلة، والزيوت المستحلبة، وغيرها من الملوثات.
وفي النهاية، يتم إزالة هذه الكتل من المياه في مراحل لاحقة من فصل المواد الصلبة والترشيح.